Nach Ende des 2. Weltkrieges stand der Schauspieler zunächst wieder vermehrt auf der Bühne, trat jedoch in den 1950er Jahren auch vereinzelt vor die Kinokamera. So übernahm er unter anderem in "Die Barrings" (1955) die Rolle des Dr. Bremer, in "Skandal um Dr. Vlimmen" (1956) war er der Dr. Treeborg und in Frank Wisbars Stalingrad-Drama "Hunde, wollt ihr ewig leben"³⁾ (1958) mimte er einen General. Bis Anfang der 1970er Jahre war dies dann seine letzter Auftritt auf der Leinwand, erst 1972 zeigte er sich den Kinozuschauer noch einmal in der Simmel-Verfilmung "Der Stoff, aus dem die Träume sind"³⁾. Zunehmend arbeitete von Klipstein nun auch für das Fernsehen, spielte beispielsweise den Bauer Bandekow in dem Mehrteiler "Bauern, Bonzen und Bomben"⁴⁾ (1973) oder wirkte zwei Jahre später als Großvater de Bonsac (Vater von Margarethe Kempowski (Edda Seippel)) in dem Zweiteiler "Tadellöser & Wolff"⁴⁾ (1975) nach dem Roman von Walter Kempowski mit, eine Rolle, die er auch in der dreiteiligen Fortsetzung "Ein Kapitel für sich"⁴⁾ (1979) übernahm. In der TV-Verfilmung nach dem Roman von Sandra Paretti "Der Winter, der ein Sommer war"⁴⁾ erlebte man ihn 1976 als Graf Sonsfeld, als Marten von Quinten gehörte er zur Besetzung der Christine Brückner-Verfilmung "Nirgendwo ist Poenichen"⁴⁾ (1980), er spielte den alten Krechting in der Serie "Die Pawlaks" (1982) und stand für die Serie "Der Elegante Hund" (1987) vor der Fernsehkamera.
Außerdem hatte von Klipstein verschiedenste Auftritte in so beliebten Krimi-Reihen wie "Die Fünfte Kolonne", "Sonderdezernat K1", "Großstadtrevier" und "Die Männer vom K3"; letztmalig erlebte man den Schauspieler 1992 in der Tatort-Folge "Experimente" auf dem Bildschirm. Neben seiner umfangreichen Arbeit für Theater, Film und Fernsehen war von Klipstein auch ein vielgefragter Synchronsprecher und wirkte bei zahlreichen Hörspielproduktionen, vornehmlich  Jugendhörspielen des Labels "Europa"³⁾, mit.
  
Ernst von Klipstein starb am 22. November 1993 im Alter von 85 Jahren; seine letzte Ruhestätte fand er auf dem Waldfriedhof in Hamburg-Volksdorf.
Er war bis zum Tod mit seiner Schauspielerkollegin Marianne Kehlau³⁾ (1925 – 2002) verheiratet. Die ersten Ehen mit den Schauspielerinnen Deli Maria Teichen, Lotte Koch⁴⁾ sowie sowie der Soubrette bzw. Schauspielerin Elisabeth Biebl¹⁾ (1915 – 1989) waren jeweils nach kurzer Zeit geschieden worden.⁵⁾